Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SFTPCP11686 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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