Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms