Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GLI3P10071 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLI3P10071 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GLI3P10071 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLI3P10071 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLI3P10071 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms