Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TMEM225BP0DP42 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms