Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RGPD1P0DJD0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RGPD1P0DJD0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms