Protein–RNA interactions for Protein: P07333

CSF1R, Macrophage colony-stimulating factor 1 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1RP07333 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CSF1RP07333 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CSF1RP07333 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms