Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPTA1P02549 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms