Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HLA-HP01893 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HLA-HP01893 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms