Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
ABCC9O60706 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
ABCC9O60706 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms