Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATP9BO43861 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATP9BO43861 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms