Protein–RNA interactions for Protein: O43559

FRS3, Fibroblast growth factor receptor substrate 3, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRS3O43559 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
FRS3O43559 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms