Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NDUFS4O43181 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NDUFS4O43181 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms