Protein–RNA interactions for Protein: O15213

WDR46, WD repeat-containing protein 46, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR46O15213 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR46O15213 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR46O15213 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
WDR46O15213 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms