Protein–RNA interactions for Protein: K7EIQ3

ZNF561-AS1, Uncharacterized protein ZNF561-AS1, humanhuman

Predictions only

Length 104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF561-AS1K7EIQ3 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ZNF561-AS1K7EIQ3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms