Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms