Protein–RNA interactions for Protein: B4E171

Tetraspanin, humanhuman

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E171 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4E171 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4E171 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4E171 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms