Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
KNCNA6PVL3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms