Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARID3CA6NKF2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms