Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
A4D1N5 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
A4D1N5 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms