Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC144AA2RUR9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC144AA2RUR9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms