Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y262

EIF3L, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3LQ9Y262 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EIF3LQ9Y262 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EIF3LQ9Y262 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
EIF3LQ9Y262 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.4 ms