Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQN3

CHMP2B, Charged multivesicular body protein 2b, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP2BQ9UQN3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHMP2BQ9UQN3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CHMP2BQ9UQN3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CHMP2BQ9UQN3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CHMP2BQ9UQN3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms