Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CFAP45Q9UL16 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CFAP45Q9UL16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CFAP45Q9UL16 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CFAP45Q9UL16 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms