Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAX2Q9UIW0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAX2Q9UIW0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
VAX2Q9UIW0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms