Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKIRAS1Q9NYS0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKIRAS1Q9NYS0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKIRAS1Q9NYS0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NKIRAS1Q9NYS0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms