Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THUMPD1Q9NXG2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
THUMPD1Q9NXG2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
THUMPD1Q9NXG2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms