Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F2

TMEM38A, Trimeric intracellular cation channel type A, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM38AQ9H6F2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM38AQ9H6F2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMEM38AQ9H6F2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM38AQ9H6F2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM38AQ9H6F2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms