Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP5

SRRT, Serrate RNA effector molecule homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRTQ9BXP5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SRRTQ9BXP5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SRRTQ9BXP5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SRRTQ9BXP5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SRRTQ9BXP5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.3 ms