Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
APOL4Q9BPW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
APOL4Q9BPW4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
APOL4Q9BPW4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms