Protein–RNA interactions for Protein: Q99829

CPNE1, Copine-1, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE1Q99829 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CPNE1Q99829 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CPNE1Q99829 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CPNE1Q99829 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CPNE1Q99829 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms