Protein–RNA interactions for Protein: Q99732

LITAF, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LITAFQ99732 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LITAFQ99732 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LITAFQ99732 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LITAFQ99732 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms