Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RBBP8Q99708 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RBBP8Q99708 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RBBP8Q99708 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms