Protein–RNA interactions for Protein: Q99325

ATG40, Autophagy-related protein 40, yeastyeast

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG40Q99325 YPR204WYPR204W 3099 nt5.48□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 CIR2YOR356W 1896 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 DAL7YIR031C 1665 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 MRPL35YDR322W 1104 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 QCR6YFR033C 444 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 RKI1YOR095C 777 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 LDB16YCL005W 771 nt5.47□□□□□ -1.53
ATG40Q99325 VMA3YEL027W 483 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 GCG1YER163C 699 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 OM45YIL136W 1182 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YUR1YJL139C 1287 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 MDE1YJR024C 735 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 AVT4YNL101W 2142 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 UTR2YEL040W 1404 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ISC1YER019W 1434 nt5.46□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 PRY3YJL078C 2646 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 COQ3YOL096C 939 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 CCT8YJL008C 1707 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 SAL1YNL083W 1485 nt5.45□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YBR284WYBR284W 2394 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 SKI2YLR398C 3864 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YLR123CYLR123C 330 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ECM31YBR176W 939 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 CEF1YMR213W 1773 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YML133CYML133C 4125 nt5.44□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ARE2YNR019W 1929 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 HEM2YGL040C 1029 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YJR154WYJR154W 1041 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 MHT1YLL062C 975 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YLR312CYLR312C 1197 nt5.43□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ERG8YMR220W 1356 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 DMA1YHR115C 1251 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 MEH1YKR007W 555 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 MSO1YNR049C 633 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YGR054WYGR054W 1929 nt5.42□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 DAL4YIR028W 1908 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ERP2YAL007C 648 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 CCC2YDR270W 3015 nt5.41□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 CYC8YBR112C 2901 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 ICS3YJL077C 396 nt5.4□□□□□ -1.54
ATG40Q99325 YEN1YER041W 2280 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 QCR8YJL166W 285 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 SRL2YLR082C 1179 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 TSR2YLR435W 618 nt5.39□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 ARG81YML099C 2643 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 GPD2YOL059W 1323 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 YIL055CYIL055C 1884 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 CRP1YHR146W 1398 nt5.38□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 IMG1YCR046C 510 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 LCB3YJL134W 1230 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 YKR045CYKR045C 552 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 ILV6YCL009C 930 nt5.37□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 KEL1YHR158C 3495 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 CIS3YJL158C 684 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 GTO3YMR251W 1101 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 IES2YNL215W 963 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 KTR1YOR099W 1182 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 YBR027CYBR027C 333 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 PTC4YBR125C 1182 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 IMA5YJL216C 1746 nt5.36□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 POP1YNL221C 2628 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 PPT1YGR123C 1542 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 ZWF1YNL241C 1518 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 UIP5YKR044W 1332 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 YOR111WYOR111W 699 nt5.35□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 EFT2YDR385W 2529 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 EFT1YOR133W 2529 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 RIO1YOR119C 1455 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 PTC3YBL056W 1407 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 GPI11YDR302W 660 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 PPM1YDR435C 987 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 POP5YAL033W 522 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 FPR3YML074C 1236 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 TPO3YPR156C 1869 nt5.34□□□□□ -1.55
ATG40Q99325 RAP1YNL216W 2484 nt5.34□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 PGM1YKL127W 1713 nt5.34□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 FRE5YOR384W 2085 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 VPS61YDR136C 573 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YGR127WYGR127W 939 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YJR084WYJR084W 1272 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 SCS7YMR272C 1155 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 MOD5YOR274W 1287 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 SGF29YCL010C 780 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 ACS1YAL054C 2142 nt5.33□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 MRPL1YDR116C 858 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 CUP2YGL166W 678 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 AIM20YIL158W 615 nt5.32□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 RBS1YDL189W 1374 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 LAG2YOL025W 1983 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 snR82snR82 268 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 BIM1YER016W 1035 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 DUS4YLR405W 1104 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 BSC4YNL269W 396 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 GEF1YJR040W 2340 nt5.31□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YMR279CYMR279C 1623 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 COX9YDL067C 180 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 PEX13YLR191W 1161 nt5.3□□□□□ -1.56
ATG40Q99325 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.1 ms