Protein–RNA interactions for Protein: Q96T66

NMNAT3, Nicotinamide/nicotinic acid mononucleotide adenylyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMNAT3Q96T66 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NMNAT3Q96T66 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NMNAT3Q96T66 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NMNAT3Q96T66 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms