Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB3IPQ96QF0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB3IPQ96QF0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB3IPQ96QF0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB3IPQ96QF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms