Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
YIPF6Q96EC8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
YIPF6Q96EC8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
YIPF6Q96EC8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms