Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
C11orf40Q8WZ69 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
C11orf40Q8WZ69 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms