Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWF1

C1orf54, Uncharacterized protein C1orf54, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf54Q8WWF1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C1orf54Q8WWF1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C1orf54Q8WWF1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1orf54Q8WWF1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1orf54Q8WWF1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
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