Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC90

CCER1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER1Q8TC90 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
CCER1Q8TC90 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.17■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
CCER1Q8TC90 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
CCER1Q8TC90 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
CCER1Q8TC90 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
CCER1Q8TC90 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms