Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD4

Uncharacterized protein FLJ76381, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8NFD4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q8NFD4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q8NFD4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8NFD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8NFD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8NFD4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8NFD4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q8NFD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8NFD4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8NFD4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8NFD4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q8NFD4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q8NFD4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8NFD4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8NFD4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8NFD4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q8NFD4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q8NFD4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q8NFD4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q8NFD4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Q8NFD4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8NFD4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8NFD4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8NFD4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8NFD4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Q8NFD4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Q8NFD4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Q8NFD4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q8NFD4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q8NFD4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Q8NFD4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q8NFD4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q8NFD4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q8NFD4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Q8NFD4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms