Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V2

TRIML1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML1, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML1Q8N9V2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIML1Q8N9V2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIML1Q8N9V2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIML1Q8N9V2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIML1Q8N9V2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 232.6 ms