Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CSGALNACT2Q8N6G5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CSGALNACT2Q8N6G5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSGALNACT2Q8N6G5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms