Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CYP4X1Q8N118 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CYP4X1Q8N118 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CYP4X1Q8N118 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms