Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FAM47EQ6ZV65 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
FAM47EQ6ZV65 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FAM47EQ6ZV65 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms