Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CAVIN1Q6NZI2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CAVIN1Q6NZI2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CAVIN1Q6NZI2 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CAVIN1Q6NZI2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms