Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
REEP3Q6NUK4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
REEP3Q6NUK4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
REEP3Q6NUK4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms