Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NANOGP8Q6NSW7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NANOGP8Q6NSW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NANOGP8Q6NSW7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms