Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXM1

ZNF678, Zinc finger protein 678, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF678Q5SXM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF678Q5SXM1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ZNF678Q5SXM1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ZNF678Q5SXM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF678Q5SXM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms