Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC92Q53HC0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC92Q53HC0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC92Q53HC0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms