Protein–RNA interactions for Protein: Q3KP44

ANKRD55, Ankyrin repeat domain-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD55Q3KP44 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ANKRD55Q3KP44 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ANKRD55Q3KP44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ANKRD55Q3KP44 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ANKRD55Q3KP44 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms